Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DNMT1P26358 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DNMT1P26358 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms