Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA3P26006 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms