Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSSP25774 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSSP25774 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSSP25774 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSSP25774 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSSP25774 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSSP25774 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSSP25774 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSSP25774 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSSP25774 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSSP25774 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSSP25774 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSSP25774 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms