Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA1P25391 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA1P25391 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms