Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCHP24723 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms