Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5F1P24539 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5F1P24539 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms