Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKACGP22612 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKACGP22612 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms