Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2P22307 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2P22307 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2P22307 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2P22307 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2P22307 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCP2P22307 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCP2P22307 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCP2P22307 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCP2P22307 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCP2P22307 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCP2P22307 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCP2P22307 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2P22307 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2P22307 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2P22307 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2P22307 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2P22307 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2P22307 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCP2P22307 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2P22307 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2P22307 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2P22307 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2P22307 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2P22307 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2P22307 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCP2P22307 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2P22307 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2P22307 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2P22307 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2P22307 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2P22307 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCP2P22307 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2P22307 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2P22307 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2P22307 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2P22307 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2P22307 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2P22307 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCP2P22307 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCP2P22307 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCP2P22307 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCP2P22307 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCP2P22307 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCP2P22307 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCP2P22307 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCP2P22307 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCP2P22307 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCP2P22307 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCP2P22307 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCP2P22307 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCP2P22307 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCP2P22307 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCP2P22307 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCP2P22307 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCP2P22307 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCP2P22307 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCP2P22307 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCP2P22307 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2P22307 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2P22307 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCP2P22307 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms