Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK11BP21127 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK11BP21127 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms