Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDSP20132 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDSP20132 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SDSP20132 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDSP20132 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDSP20132 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDSP20132 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDSP20132 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDSP20132 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDSP20132 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDSP20132 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDSP20132 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDSP20132 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDSP20132 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDSP20132 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDSP20132 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDSP20132 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDSP20132 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDSP20132 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDSP20132 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDSP20132 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDSP20132 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDSP20132 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SDSP20132 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SDSP20132 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDSP20132 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDSP20132 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDSP20132 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDSP20132 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDSP20132 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDSP20132 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDSP20132 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDSP20132 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SDSP20132 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDSP20132 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDSP20132 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDSP20132 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDSP20132 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms