Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B1P20020 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP2B1P20020 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms