Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNI3P19429 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNI3P19429 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNNI3P19429 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI3P19429 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI3P19429 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNNI3P19429 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI3P19429 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI3P19429 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI3P19429 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI3P19429 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNNI3P19429 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms