Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCP1P17987 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCP1P17987 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCP1P17987 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCP1P17987 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCP1P17987 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCP1P17987 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCP1P17987 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCP1P17987 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCP1P17987 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCP1P17987 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCP1P17987 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCP1P17987 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCP1P17987 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCP1P17987 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TCP1P17987 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCP1P17987 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCP1P17987 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCP1P17987 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCP1P17987 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCP1P17987 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms