Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XBP1P17861 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XBP1P17861 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XBP1P17861 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XBP1P17861 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XBP1P17861 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XBP1P17861 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XBP1P17861 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
XBP1P17861 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XBP1P17861 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XBP1P17861 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XBP1P17861 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
XBP1P17861 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XBP1P17861 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XBP1P17861 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XBP1P17861 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XBP1P17861 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XBP1P17861 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XBP1P17861 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XBP1P17861 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
XBP1P17861 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XBP1P17861 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XBP1P17861 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XBP1P17861 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XBP1P17861 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
XBP1P17861 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XBP1P17861 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms