Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CAPN2P17655 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPN2P17655 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms