Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFXP16104 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms