Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RAP15509 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RAP15509 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms