Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VAV1P15498 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VAV1P15498 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VAV1P15498 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAV1P15498 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAV1P15498 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAV1P15498 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAV1P15498 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAV1P15498 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAV1P15498 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAV1P15498 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAV1P15498 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAV1P15498 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAV1P15498 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAV1P15498 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAV1P15498 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAV1P15498 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms