Protein–RNA interactions for Protein: P15382

KCNE1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE1P15382 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNE1P15382 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNE1P15382 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms