Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXB3P14651 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms