Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM27P14373 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms