Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT5P13647 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT5P13647 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT5P13647 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT5P13647 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT5P13647 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT5P13647 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT5P13647 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT5P13647 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT5P13647 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT5P13647 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT5P13647 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT5P13647 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT5P13647 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT5P13647 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT5P13647 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT5P13647 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms