Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL4P13236 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL4P13236 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL4P13236 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL4P13236 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL4P13236 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL4P13236 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL4P13236 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL4P13236 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL4P13236 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL4P13236 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL4P13236 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL4P13236 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL4P13236 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL4P13236 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL4P13236 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL4P13236 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL4P13236 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL4P13236 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL4P13236 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL4P13236 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL4P13236 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL4P13236 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL4P13236 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms