Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTN1P12814 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN1P12814 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms