Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP2P12643 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP2P12643 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP2P12643 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP2P12643 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP2P12643 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP2P12643 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP2P12643 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP2P12643 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP2P12643 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BMP2P12643 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP2P12643 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP2P12643 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BMP2P12643 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP2P12643 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP2P12643 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP2P12643 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP2P12643 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP2P12643 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BMP2P12643 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP2P12643 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP2P12643 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms