Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CKBP12277 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKBP12277 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKBP12277 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKBP12277 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKBP12277 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKBP12277 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKBP12277 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKBP12277 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKBP12277 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CKBP12277 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKBP12277 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKBP12277 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKBP12277 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKBP12277 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKBP12277 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKBP12277 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKBP12277 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKBP12277 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKBP12277 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKBP12277 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKBP12277 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKBP12277 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKBP12277 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKBP12277 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKBP12277 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKBP12277 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKBP12277 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKBP12277 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms