Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT3P12035 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT3P12035 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT3P12035 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT3P12035 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT3P12035 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT3P12035 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT3P12035 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT3P12035 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT3P12035 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT3P12035 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT3P12035 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT3P12035 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT3P12035 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT3P12035 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT3P12035 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT3P12035 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT3P12035 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT3P12035 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT3P12035 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT3P12035 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT3P12035 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT3P12035 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT3P12035 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT3P12035 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT3P12035 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT3P12035 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT3P12035 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT3P12035 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT3P12035 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT3P12035 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT3P12035 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT3P12035 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT3P12035 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT3P12035 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT3P12035 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT3P12035 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT3P12035 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT3P12035 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT3P12035 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms