Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MS4A1P11836 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MS4A1P11836 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms