Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
TOP2AP11388 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
TOP2AP11388 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
TOP2AP11388 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
TOP2AP11388 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
TOP2AP11388 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
TOP2AP11388 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
TOP2AP11388 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC40.05■■■■■ 4
TOP2AP11388 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
TOP2AP11388 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
TOP2AP11388 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
TOP2AP11388 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
TOP2AP11388 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
TOP2AP11388 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
TOP2AP11388 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
TOP2AP11388 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
TOP2AP11388 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
TOP2AP11388 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TOP2AP11388 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TOP2AP11388 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
TOP2AP11388 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TOP2AP11388 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TOP2AP11388 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TOP2AP11388 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
TOP2AP11388 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TOP2AP11388 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TOP2AP11388 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
TOP2AP11388 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TOP2AP11388 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC40■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
TOP2AP11388 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms