Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHGAP10645 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHGAP10645 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHGAP10645 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHGAP10645 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHGAP10645 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHGAP10645 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHGAP10645 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHGAP10645 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHGAP10645 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHGAP10645 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHGAP10645 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CHGAP10645 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHGAP10645 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHGAP10645 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHGAP10645 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CHGAP10645 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHGAP10645 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHGAP10645 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHGAP10645 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHGAP10645 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHGAP10645 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHGAP10645 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHGAP10645 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHGAP10645 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHGAP10645 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHGAP10645 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHGAP10645 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHGAP10645 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHGAP10645 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHGAP10645 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHGAP10645 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CHGAP10645 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHGAP10645 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHGAP10645 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHGAP10645 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHGAP10645 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHGAP10645 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHGAP10645 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHGAP10645 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHGAP10645 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CHGAP10645 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHGAP10645 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHGAP10645 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms