Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2BP0DI82 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms