Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2P0DI81 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2P0DI81 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms