Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM49P0CI25 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM49P0CI25 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms