Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC172P0C7W6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms