Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3P09919 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3P09919 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3P09919 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3P09919 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF3P09919 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF3P09919 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF3P09919 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF3P09919 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF3P09919 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF3P09919 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF3P09919 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF3P09919 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF3P09919 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF3P09919 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF3P09919 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF3P09919 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF3P09919 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms