Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA5P08648 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA5P08648 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA5P08648 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms