Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTMAP06454 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTMAP06454 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTMAP06454 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTMAP06454 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTMAP06454 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTMAP06454 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTMAP06454 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTMAP06454 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTMAP06454 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTMAP06454 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTMAP06454 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTMAP06454 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTMAP06454 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTMAP06454 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTMAP06454 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTMAP06454 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTMAP06454 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTMAP06454 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTMAP06454 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTMAP06454 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTMAP06454 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTMAP06454 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTMAP06454 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTMAP06454 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTMAP06454 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTMAP06454 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTMAP06454 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTMAP06454 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTMAP06454 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTMAP06454 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTMAP06454 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTMAP06454 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTMAP06454 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms