Protein–RNA interactions for Protein: P06315

IGKV5-2, Immunoglobulin kappa variable 5-2, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV5-2P06315 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGKV5-2P06315 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
IGKV5-2P06315 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGKV5-2P06315 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IGKV5-2P06315 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGKV5-2P06315 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGKV5-2P06315 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IGKV5-2P06315 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGKV5-2P06315 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms