Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPIND1P05546 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms