Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A1P02730 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A1P02730 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A1P02730 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms