Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HLA-DRAP01903 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms