Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGHV3-7P01780 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHV3-7P01780 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHV3-7P01780 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHV3-7P01780 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHV3-7P01780 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHV3-7P01780 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHV3-7P01780 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHV3-7P01780 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms