Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPP00450 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPP00450 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPP00450 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPP00450 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPP00450 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPP00450 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPP00450 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPP00450 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPP00450 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPP00450 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPP00450 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPP00450 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPP00450 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPP00450 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPP00450 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPP00450 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPP00450 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPP00450 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPP00450 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPP00450 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPP00450 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPP00450 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPP00450 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPP00450 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPP00450 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPP00450 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPP00450 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPP00450 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPP00450 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPP00450 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPP00450 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPP00450 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPP00450 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPP00450 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPP00450 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPP00450 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPP00450 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPP00450 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPP00450 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPP00450 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPP00450 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPP00450 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPP00450 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPP00450 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPP00450 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPP00450 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPP00450 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPP00450 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms