Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYF2O95926 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYF2O95926 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYF2O95926 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYF2O95926 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYF2O95926 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYF2O95926 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYF2O95926 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYF2O95926 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYF2O95926 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYF2O95926 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYF2O95926 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYF2O95926 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYF2O95926 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYF2O95926 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYF2O95926 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYF2O95926 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYF2O95926 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYF2O95926 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYF2O95926 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYF2O95926 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYF2O95926 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYF2O95926 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYF2O95926 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYF2O95926 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYF2O95926 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYF2O95926 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYF2O95926 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYF2O95926 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYF2O95926 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYF2O95926 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYF2O95926 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYF2O95926 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYF2O95926 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYF2O95926 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYF2O95926 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYF2O95926 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYF2O95926 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms