Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL1O95922 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL1O95922 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms