Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLR1AO95602 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR1AO95602 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms