Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX6O95503 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX6O95503 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX6O95503 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX6O95503 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX6O95503 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX6O95503 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX6O95503 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX6O95503 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX6O95503 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX6O95503 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBX6O95503 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX6O95503 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms