Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTDNEP1O95476 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1O95476 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms