Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4BO95155 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4BO95155 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms