Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG2O94898 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms